SLE nadiren kalbi tutar. En sık görülen sorun kalp kapak hastalığıdır. Kalp kapaklarında kaçaklar ve kalınlaşma SLE’ye eşlik edebilir. Yine kalp zarı çevresinde sıvı toplanması SLE’de bildirilmiştir. Bunlara ek olarak kalp ritm bozuklukları ve kalp kasında yetersizlik (kalp yetmezliği) de görülebilir.